N�gy �v telik el az el�z� sorozat v�ge �ta. A kiv�lasztottak �lik tov�bb mindennapi �let�ket, de kalandjaikat sohasem fogj�k elfelejteni. TK �s Kari folytatja tanulm�nyait az iskol�ban �s �j bar�tokat szereznek Davis, Juli �s Cody szem�ly�ben.
Egy nap seg�lyk�r�st kapnak a DigiVil�gb�l, mert egy �j ellens�g bukkant fel. Ez az ellens�g egy fiatal sr�c, aki Digimon Cs�sz�rnak nevezi mag�t. A terve az, hogy az �ltala l�trehozott fekete tornyokkal megg�tolja a digimon-ok digit�ci�s k�pess�g�t, �gy ig�zva le vil�gukat.
Davis, Juli �s Cody egy teljesen �j D3 DigiVice-ot kap, miut�n megismert�k digimonjaikat (Veemon, Hawkmon �s Armodillomon). Ennek a DigiVice-nak a seg�ts�g�vel szabadon tudnak �tj�rni k�t vil�g k�z�tt. Miut�n Kari �s TK birtok�ban lev�k �talakulnak D3-m�, megkezd�dik a harc a rejt�lyes Digimon Cs�sz�r ellen…